Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 ADF1YCL058W-A 342 nt1.56□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 CHC1YGL206C 4962 nt1.56□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 VPH1YOR270C 2523 nt1.56□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 DAD4YDR320C-A 219 nt1.55□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 COX3Q0275 810 nt1.55□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt1.55□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 VTI1YMR197C 654 nt1.55□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 SFM1YOR021C 642 nt1.55□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 NSL1YPL233W 651 nt1.55□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 VID24YBR105C 1089 nt1.55□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 KAR9YPL269W 1935 nt1.55□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt1.55□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 VPS38YLR360W 1320 nt1.55□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 IRA1YBR140C 9279 nt1.55□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 CAT2YML042W 2013 nt1.55□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 VPS15YBR097W 4365 nt1.55□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 PEP1YBL017C 4740 nt1.55□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 HCS1YKL017C 2052 nt1.54□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 SYM1YLR251W 594 nt1.54□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YML084WYML084W 309 nt1.54□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 ICY1YMR195W 384 nt1.54□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 NCS2YNL119W 1482 nt1.54□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 CFT1YDR301W 4074 nt1.53□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 MEC1YBR136W 7107 nt1.53□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 NCB2YDR397C 441 nt1.53□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 SLM1YIL105C 2061 nt1.53□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YJL086CYJL086C 369 nt1.53□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 SHE2YKL130C 741 nt1.53□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 PDP3YLR455W 915 nt1.53□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 MRPL44YMR225C 297 nt1.53□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 ARL3YPL051W 597 nt1.53□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 MED8YBR193C 672 nt1.53□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YBP1YBR216C 2025 nt1.53□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 BPH1YCR032W 6504 nt1.52□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 RTT107YHR154W 3213 nt1.52□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 SSF1YHR066W 1362 nt1.52□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YDR115WYDR115W 318 nt1.52□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YDR248CYDR248C 582 nt1.52□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YGR115CYGR115C 780 nt1.52□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt1.52□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 CCW14YLR390W-A 717 nt1.52□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YNL226WYNL226W 411 nt1.52□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YPL034WYPL034W 498 nt1.52□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YBR287WYBR287W 1284 nt1.52□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 LEU3YLR451W 2661 nt1.51□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 PBP4YDL053C 558 nt1.51□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 snR78snR78 87 nt1.51□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 GPI8YDR331W 1236 nt1.51□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 ATP17YDR377W 306 nt1.51□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YIP1YGR172C 747 nt1.51□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YPT6YLR262C 648 nt1.51□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YNL179CYNL179C 438 nt1.51□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 RIO2YNL207W 1278 nt1.51□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 IPP1YBR011C 864 nt1.51□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YOR146WYOR146W 306 nt1.51□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 TRL1YJL087C 2484 nt1.51□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 RKM1YPL208W 1752 nt1.5□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 DAD1YDR016C 285 nt1.5□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 VPS74YDR372C 1038 nt1.5□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YGL069CYGL069C 465 nt1.5□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 SOK2YMR016C 2358 nt1.5□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 PEX8YGR077C 1770 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YJL070CYJL070C 2667 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 CCH1YGR217W 6120 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 SBE22YHR103W 2559 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 TDA2YER071C 381 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 PGD1YGL025C 1194 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 SDL1YIL167W 633 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 LSM2YBL026W 288 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 HHT2YNL031C 411 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YNL235CYNL235C 432 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 ATX2YOR079C 942 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 POP7YBR167C 423 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YCL007CYCL007C 393 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YCL023CYCL023C 348 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 UBP11YKR098C 2154 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 ECM25YJL201W 1800 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.49□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 snR59snR59 78 nt1.48□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YFR056CYFR056C 369 nt1.48□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YGL042CYGL042C 306 nt1.48□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt1.48□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YIL082WYIL082W 873 nt1.48□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 HYR1YIR037W 492 nt1.48□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 SNC1YAL030W 354 nt1.48□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YLR302CYLR302C 363 nt1.48□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 TFC8YPL007C 1767 nt1.47□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 FMP16YDR070C 282 nt1.47□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 TSA2YDR453C 591 nt1.47□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 RSM18YER050C 417 nt1.47□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YGL109WYGL109W 324 nt1.47□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 BMT5YIL096C 1011 nt1.47□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 NCE101YJL205C 162 nt1.47□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 YJR023CYJR023C 402 nt1.47□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 OST2YOR103C 393 nt1.47□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 GRX5YPL059W 453 nt1.47□□□□□ -2.17
NEJ1Q06148 UBP1YDL122W 2430 nt1.46□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 SHE4YOR035C 2370 nt1.46□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 UBC5YDR059C 447 nt1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 150.5 ms