Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms