Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.09□□□□□ -2.07
YHC1Q05900 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.09□□□□□ -2.07
YHC1Q05900 SIN3YOL004W 4611 nt2.09□□□□□ -2.07
YHC1Q05900 MGM1YOR211C 2646 nt2.09□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 TOP2YNL088W 4287 nt2.09□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.08□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 RLI1YDR091C 1827 nt2.08□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 YDR199WYDR199W 366 nt2.08□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 RPL27BYDR471W 411 nt2.08□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 MPO1YGL010W 525 nt2.08□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 SPC1YJR010C-A 285 nt2.08□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 RNP1YLL046C 750 nt2.08□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 YHC1YLR298C 696 nt2.08□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 YLR456WYLR456W 615 nt2.08□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 TOA1YOR194C 861 nt2.08□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 YBR197CYBR197C 654 nt2.08□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 KSP1YHR082C 3090 nt2.08□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 BUB1YGR188C 3066 nt2.07□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 PHR1YOR386W 1698 nt2.07□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 IRC4YDR540C 540 nt2.07□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 GCN4YEL009C 846 nt2.07□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 DGR1YNL130C-A 147 nt2.07□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 SWM2YNR004W 441 nt2.07□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 VMA9YCL005W-A 222 nt2.07□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 PSO2YMR137C 1986 nt2.07□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 SDC25YLL016W 3147 nt2.06□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 YPR089WYPR089W 2667 nt2.06□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 AMS1YGL156W 3252 nt2.06□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 NDD1YOR372C 1665 nt2.06□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 ECM25YJL201W 1800 nt2.06□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 UTP22YGR090W 3714 nt2.06□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 AHC2YCR082W 387 nt2.06□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 GPI8YDR331W 1236 nt2.06□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 RPL9AYGL147C 576 nt2.06□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 LAG1YHL003C 1236 nt2.06□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 YKL044WYKL044W 321 nt2.06□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.06□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 TRM7YBR061C 933 nt2.06□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 ALK2YBL009W 2031 nt2.06□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 VPS41YDR080W 2979 nt2.05□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 SPP41YDR464W 4308 nt2.05□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 UTP13YLR222C 2454 nt2.05□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 TIM10YHR005C-A 282 nt2.05□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 AYR1YIL124W 894 nt2.05□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 RPL16AYIL133C 600 nt2.05□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.05□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 RPL37AYLR185W 267 nt2.05□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 RPL36AYMR194W 303 nt2.05□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 YNL122CYNL122C 348 nt2.05□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 RPL25YOL127W 429 nt2.05□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 GAL7YBR018C 1101 nt2.05□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 FAR11YNL127W 2862 nt2.05□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 BRE1YDL074C 2103 nt2.05□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 HOS4YIL112W 3252 nt2.04□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 GIS1YDR096W 2685 nt2.04□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 PES4YFR023W 1836 nt2.04□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 DPB11YJL090C 2295 nt2.04□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 YJL202CYJL202C 348 nt2.04□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 YJR023CYJR023C 402 nt2.04□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 UFD4YKL010C 4452 nt2.04□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 VPH2YKL119C 648 nt2.04□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 YJL070CYJL070C 2667 nt2.04□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 MCD1YDL003W 1701 nt2.03□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 SNU114YKL173W 3027 nt2.03□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 YDR220CYDR220C 294 nt2.03□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 MXR1YER042W 555 nt2.03□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.03□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 YIL058WYIL058W 285 nt2.03□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 GPI15YNL038W 690 nt2.03□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.03□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 STH1YIL126W 4080 nt2.03□□□□□ -2.08
YHC1Q05900 SSY1YDR160W 2559 nt2.03□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 HRD3YLR207W 2502 nt2.02□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 SCH9YHR205W 2475 nt2.02□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 NOP14YDL148C 2433 nt2.02□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 PRP6YBR055C 2700 nt2.02□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 SWA2YDR320C 2007 nt2.02□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 YCR108CYCR108C 192 nt2.02□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 RPS24AYER074W 408 nt2.02□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 YGR050CYGR050C 357 nt2.02□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 YAP3YHL009C 993 nt2.02□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 PEP8YJL053W 1140 nt2.02□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 NOP15YNL110C 663 nt2.02□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 IGO1YNL157W 507 nt2.02□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 PET123YOR158W 957 nt2.02□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 RRP12YPL012W 3687 nt2.02□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 EDS1YBR033W 2760 nt2.02□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 YDR509WYDR509W 348 nt2.01□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 SMB1YER029C 591 nt2.01□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 VTC1YER072W 390 nt2.01□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.01□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 YGL165CYGL165C 579 nt2.01□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 YHR130CYHR130C 336 nt2.01□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.01□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 TPM2YIL138C 486 nt2.01□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 HYR1YIR037W 492 nt2.01□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 YKR051WYKR051W 1257 nt2.01□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 CMS1YLR003C 876 nt2.01□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 VPS20YMR077C 666 nt2.01□□□□□ -2.09
YHC1Q05900 PBI2YNL015W 228 nt2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.8 ms