Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms