Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP7AQ04656 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms