Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 UBC5YDR059C 447 nt1.56□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 YFR057WYFR057W 456 nt1.56□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 VMA7YGR020C 357 nt1.56□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 RPA34YJL148W 702 nt1.56□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 YOR146WYOR146W 306 nt1.56□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 SRL4YPL033C 846 nt1.56□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 NSL1YPL233W 651 nt1.56□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 SUS1YBR111W-A 291 nt1.56□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 BRR2YER172C 6492 nt1.56□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 PRK1YIL095W 2433 nt1.56□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 YNL034WYNL034W 1839 nt1.55□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 NIC96YFR002W 2520 nt1.55□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 FMP16YDR070C 282 nt1.55□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 VPS63YLR261C 327 nt1.55□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 CSI1YMR025W 888 nt1.55□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 MET18YIL128W 3099 nt1.55□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 YFR056CYFR056C 369 nt1.54□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt1.54□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 MEI5YPL121C 669 nt1.54□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 RXT2YBR095C 1293 nt1.54□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 BPH1YCR032W 6504 nt1.54□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 PKH3YDR466W 2697 nt1.53□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 GEP7YGL057C 864 nt1.53□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 ECM25YJL201W 1800 nt1.53□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 HCS1YKL017C 2052 nt1.53□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 SHE2YKL130C 741 nt1.53□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 UBP11YKR098C 2154 nt1.53□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 CAT8YMR280C 4302 nt1.53□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 YNR021WYNR021W 1215 nt1.53□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 YBP1YBR216C 2025 nt1.53□□□□□ -2.16
TRM12Q04235 ASG1YIL130W 2895 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 CDC50YCR094W 1176 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YDL157CYDL157C 357 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 ATP17YDR377W 306 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 LOC1YFR001W 615 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YGL230CYGL230C 444 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YHL037CYHL037C 402 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YLR302CYLR302C 363 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 SPC2YML055W 537 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 ARL3YPL051W 597 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 SLM1YIL105C 2061 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 LHS1YKL073W 2646 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 SBE22YHR103W 2559 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YDL163WYDL163W 303 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 RSM28YDR494W 1086 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YGL069CYGL069C 465 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YGL165CYGL165C 579 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 RSM27YGR215W 333 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YGR242WYGR242W 309 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 ATG38YLR211C 681 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 HRI1YLR301W 735 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 LSM2YBL026W 288 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 PTC5YOR090C 1719 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 SOK2YMR016C 2358 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 HSL1YKL101W 4557 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 SDL1YIL167W 633 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 SNC1YAL030W 354 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YHC1YLR298C 696 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 OST2YOR103C 393 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YOR169CYOR169C 465 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 SAR1YPL218W 573 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 AHC2YCR082W 387 nt1.49□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YDR199WYDR199W 366 nt1.49□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 RSM18YER050C 417 nt1.49□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 CWC23YGL128C 852 nt1.49□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YJL086CYJL086C 369 nt1.49□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 PFD1YJL179W 330 nt1.49□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YOR333CYOR333C 417 nt1.49□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 CHS1YNL192W 3396 nt1.49□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 LYS9YNR050C 1341 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 DAD1YDR016C 285 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 RPL37BYDR500C 267 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 PRS3YHL011C 963 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 COX3Q0275 810 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 RAM2YKL019W 951 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YAL064WYAL064W 285 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YLR217WYLR217W 324 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 GIM3YNL153C 390 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YPR177CYPR177C 372 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 RKM1YPL208W 1752 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 SAC3YDR159W 3906 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 VPS35YJL154C 2835 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 MNE1YOR350C 1992 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 TSA2YDR453C 591 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YIL102CYIL102C 306 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 LCL2YLR104W 396 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 SYM1YLR251W 594 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 MRPL44YMR225C 297 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 SWM2YNR004W 441 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 ATX2YOR079C 942 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 TOA1YOR194C 861 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 CDC31YOR257W 486 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 YPL034WYPL034W 498 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM12Q04235 TFC8YPL007C 1767 nt1.47□□□□□ -2.17
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