Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ERCC6Q03468 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms