Protein–RNA interactions for Protein: Q02985

CFHR3, Complement factor H-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR3Q02985 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR3Q02985 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms