Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms