Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ID3Q02535 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ID3Q02535 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ID3Q02535 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ID3Q02535 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ID3Q02535 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ID3Q02535 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ID3Q02535 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ID3Q02535 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ID3Q02535 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ID3Q02535 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ID3Q02535 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ID3Q02535 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ID3Q02535 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ID3Q02535 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ID3Q02535 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ID3Q02535 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ID3Q02535 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ID3Q02535 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ID3Q02535 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ID3Q02535 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ID3Q02535 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ID3Q02535 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ID3Q02535 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ID3Q02535 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ID3Q02535 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ID3Q02535 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ID3Q02535 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ID3Q02535 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ID3Q02535 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ID3Q02535 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ID3Q02535 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms