Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms