Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms