Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms