Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms