Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms