Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms