Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms