Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK6Q00534 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms