Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKL1Q00532 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms