Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD1P98174 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD1P98174 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD1P98174 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD1P98174 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD1P98174 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD1P98174 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD1P98174 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD1P98174 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD1P98174 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD1P98174 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD1P98174 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD1P98174 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD1P98174 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD1P98174 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD1P98174 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD1P98174 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD1P98174 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD1P98174 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD1P98174 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD1P98174 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD1P98174 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD1P98174 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD1P98174 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD1P98174 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD1P98174 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD1P98174 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD1P98174 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms