Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOMO3P69849 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOMO3P69849 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOMO3P69849 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOMO3P69849 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOMO3P69849 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NOMO3P69849 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NOMO3P69849 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NOMO3P69849 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NOMO3P69849 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms