Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms