Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP2P63027 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms