Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms