Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-16P61578 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-16P61578 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms