Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms