Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms