Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms