Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms