Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms