Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMTNP53814 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMTNP53814 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMTNP53814 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMTNP53814 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMTNP53814 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMTNP53814 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMTNP53814 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMTNP53814 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMTNP53814 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMTNP53814 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMTNP53814 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNP53814 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNP53814 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNP53814 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNP53814 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNP53814 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNP53814 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNP53814 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNP53814 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNP53814 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNP53814 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNP53814 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNP53814 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNP53814 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNP53814 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNP53814 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNP53814 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNP53814 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNP53814 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNP53814 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNP53814 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNP53814 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNP53814 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNP53814 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNP53814 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNP53814 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNP53814 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNP53814 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNP53814 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNP53814 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms