Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms