Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAMP50895 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAMP50895 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAMP50895 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAMP50895 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAMP50895 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAMP50895 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAMP50895 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAMP50895 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAMP50895 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAMP50895 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAMP50895 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAMP50895 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAMP50895 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAMP50895 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAMP50895 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAMP50895 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAMP50895 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAMP50895 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAMP50895 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAMP50895 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAMP50895 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAMP50895 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAMP50895 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAMP50895 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAMP50895 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAMP50895 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAMP50895 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAMP50895 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAMP50895 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAMP50895 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAMP50895 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAMP50895 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAMP50895 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAMP50895 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAMP50895 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAMP50895 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAMP50895 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAMP50895 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAMP50895 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAMP50895 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAMP50895 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAMP50895 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAMP50895 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAMP50895 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAMP50895 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAMP50895 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAMP50895 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAMP50895 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAMP50895 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAMP50895 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAMP50895 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAMP50895 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAMP50895 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAMP50895 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAMP50895 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAMP50895 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAMP50895 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAMP50895 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAMP50895 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAMP50895 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAMP50895 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAMP50895 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAMP50895 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAMP50895 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAMP50895 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAMP50895 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAMP50895 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAMP50895 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAMP50895 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAMP50895 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAMP50895 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAMP50895 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAMP50895 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAMP50895 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAMP50895 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAMP50895 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAMP50895 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAMP50895 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAMP50895 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAMP50895 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAMP50895 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAMP50895 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAMP50895 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAMP50895 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAMP50895 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAMP50895 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAMP50895 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAMP50895 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAMP50895 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAMP50895 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAMP50895 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAMP50895 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAMP50895 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAMP50895 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAMP50895 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAMP50895 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAMP50895 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAMP50895 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAMP50895 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms