Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK2P49760 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK2P49760 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK2P49760 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK2P49760 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK2P49760 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK2P49760 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK2P49760 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK2P49760 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK2P49760 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK2P49760 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK2P49760 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK2P49760 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK2P49760 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK2P49760 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK2P49760 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK2P49760 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK2P49760 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK2P49760 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK2P49760 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK2P49760 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK2P49760 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK2P49760 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK2P49760 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK2P49760 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK2P49760 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK2P49760 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK2P49760 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK2P49760 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK2P49760 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK2P49760 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK2P49760 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK2P49760 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK2P49760 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK2P49760 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK2P49760 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK2P49760 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK2P49760 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK2P49760 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK2P49760 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK2P49760 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK2P49760 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK2P49760 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK2P49760 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK2P49760 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK2P49760 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK2P49760 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK2P49760 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK2P49760 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK2P49760 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK2P49760 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK2P49760 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK2P49760 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK2P49760 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK2P49760 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK2P49760 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms