Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLK1P49759 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLK1P49759 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLK1P49759 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLK1P49759 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLK1P49759 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLK1P49759 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLK1P49759 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLK1P49759 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLK1P49759 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLK1P49759 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLK1P49759 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLK1P49759 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms