Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC11A1P49279 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC11A1P49279 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC11A1P49279 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC11A1P49279 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC11A1P49279 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC11A1P49279 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC11A1P49279 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC11A1P49279 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC11A1P49279 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC11A1P49279 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC11A1P49279 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC11A1P49279 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC11A1P49279 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC11A1P49279 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC11A1P49279 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC11A1P49279 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC11A1P49279 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms