Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM4P49221 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM4P49221 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM4P49221 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM4P49221 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM4P49221 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM4P49221 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM4P49221 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM4P49221 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM4P49221 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM4P49221 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM4P49221 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM4P49221 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM4P49221 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM4P49221 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM4P49221 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM4P49221 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM4P49221 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM4P49221 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM4P49221 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM4P49221 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM4P49221 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM4P49221 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM4P49221 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM4P49221 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM4P49221 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM4P49221 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM4P49221 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM4P49221 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM4P49221 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM4P49221 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM4P49221 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM4P49221 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM4P49221 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM4P49221 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM4P49221 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM4P49221 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM4P49221 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM4P49221 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM4P49221 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM4P49221 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TGM4P49221 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TGM4P49221 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TGM4P49221 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TGM4P49221 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TGM4P49221 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms