Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NESP48681 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NESP48681 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NESP48681 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NESP48681 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NESP48681 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NESP48681 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NESP48681 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NESP48681 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NESP48681 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NESP48681 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NESP48681 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NESP48681 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
NESP48681 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NESP48681 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NESP48681 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NESP48681 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NESP48681 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NESP48681 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NESP48681 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NESP48681 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NESP48681 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
NESP48681 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
NESP48681 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
NESP48681 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NESP48681 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NESP48681 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NESP48681 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NESP48681 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NESP48681 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NESP48681 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NESP48681 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NESP48681 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NESP48681 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NESP48681 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NESP48681 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NESP48681 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NESP48681 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NESP48681 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NESP48681 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
NESP48681 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NESP48681 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NESP48681 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
NESP48681 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NESP48681 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NESP48681 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NESP48681 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
NESP48681 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NESP48681 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
NESP48681 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NESP48681 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NESP48681 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NESP48681 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NESP48681 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
NESP48681 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NESP48681 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NESP48681 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NESP48681 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NESP48681 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
NESP48681 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NESP48681 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NESP48681 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NESP48681 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NESP48681 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NESP48681 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NESP48681 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NESP48681 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NESP48681 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
NESP48681 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NESP48681 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NESP48681 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NESP48681 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NESP48681 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NESP48681 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.3
NESP48681 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
NESP48681 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NESP48681 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NESP48681 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NESP48681 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NESP48681 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
NESP48681 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NESP48681 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NESP48681 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NESP48681 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NESP48681 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms