Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLCP48506 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLCP48506 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLCP48506 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLCP48506 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLCP48506 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLCP48506 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLCP48506 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLCP48506 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLCP48506 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLCP48506 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLCP48506 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLCP48506 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLCP48506 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLCP48506 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLCP48506 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLCP48506 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLCP48506 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLCP48506 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLCP48506 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLCP48506 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLCP48506 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLCP48506 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLCP48506 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLCP48506 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLCP48506 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLCP48506 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLCP48506 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLCP48506 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLCP48506 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLCP48506 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLCP48506 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLCP48506 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLCP48506 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLCP48506 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLCP48506 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLCP48506 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLCP48506 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLCP48506 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLCP48506 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLCP48506 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLCP48506 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLCP48506 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLCP48506 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLCP48506 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLCP48506 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLCP48506 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLCP48506 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLCP48506 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLCP48506 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLCP48506 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLCP48506 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLCP48506 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLCP48506 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLCP48506 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLCP48506 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLCP48506 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLCP48506 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLCP48506 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLCP48506 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLCP48506 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms