Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IQGAP1P46940 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IQGAP1P46940 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms