Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP5P45974 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP5P45974 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP5P45974 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP5P45974 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP5P45974 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP5P45974 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP5P45974 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP5P45974 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP5P45974 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP5P45974 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP5P45974 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP5P45974 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP5P45974 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP5P45974 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP5P45974 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP5P45974 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP5P45974 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP5P45974 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP5P45974 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP5P45974 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP5P45974 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP5P45974 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP5P45974 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP5P45974 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP5P45974 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP5P45974 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP5P45974 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP5P45974 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP5P45974 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP5P45974 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP5P45974 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP5P45974 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP5P45974 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP5P45974 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP5P45974 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP5P45974 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP5P45974 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP5P45974 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP5P45974 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP5P45974 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP5P45974 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP5P45974 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP5P45974 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP5P45974 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP5P45974 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP5P45974 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP5P45974 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP5P45974 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP5P45974 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP5P45974 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP5P45974 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP5P45974 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP5P45974 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP5P45974 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP5P45974 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP5P45974 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP5P45974 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms