Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPOP42166 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMPOP42166 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMPOP42166 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMPOP42166 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMPOP42166 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMPOP42166 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMPOP42166 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMPOP42166 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMPOP42166 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMPOP42166 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMPOP42166 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMPOP42166 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMPOP42166 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMPOP42166 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMPOP42166 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMPOP42166 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMPOP42166 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMPOP42166 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMPOP42166 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMPOP42166 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMPOP42166 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TMPOP42166 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TMPOP42166 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMPOP42166 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMPOP42166 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMPOP42166 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMPOP42166 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMPOP42166 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMPOP42166 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMPOP42166 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TMPOP42166 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMPOP42166 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMPOP42166 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMPOP42166 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMPOP42166 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMPOP42166 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMPOP42166 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMPOP42166 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMPOP42166 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMPOP42166 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMPOP42166 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMPOP42166 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMPOP42166 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMPOP42166 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMPOP42166 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMPOP42166 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMPOP42166 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPOP42166 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPOP42166 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPOP42166 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPOP42166 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPOP42166 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPOP42166 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPOP42166 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPOP42166 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPOP42166 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPOP42166 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPOP42166 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPOP42166 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPOP42166 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPOP42166 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPOP42166 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPOP42166 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMPOP42166 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMPOP42166 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMPOP42166 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMPOP42166 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMPOP42166 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMPOP42166 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMPOP42166 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMPOP42166 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMPOP42166 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMPOP42166 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMPOP42166 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPOP42166 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPOP42166 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPOP42166 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPOP42166 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPOP42166 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPOP42166 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPOP42166 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms