Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms