Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHMBP2P38935 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms