Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBRP36941 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBRP36941 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBRP36941 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBRP36941 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBRP36941 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBRP36941 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBRP36941 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBRP36941 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBRP36941 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBRP36941 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBRP36941 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBRP36941 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBRP36941 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBRP36941 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LTBRP36941 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBRP36941 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBRP36941 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBRP36941 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBRP36941 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBRP36941 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBRP36941 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBRP36941 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBRP36941 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBRP36941 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBRP36941 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBRP36941 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBRP36941 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBRP36941 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBRP36941 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBRP36941 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBRP36941 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBRP36941 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBRP36941 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBRP36941 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBRP36941 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBRP36941 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBRP36941 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBRP36941 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBRP36941 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBRP36941 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBRP36941 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBRP36941 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBRP36941 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBRP36941 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBRP36941 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBRP36941 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBRP36941 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBRP36941 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBRP36941 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBRP36941 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBRP36941 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBRP36941 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBRP36941 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBRP36941 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBRP36941 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBRP36941 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBRP36941 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBRP36941 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBRP36941 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBRP36941 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBRP36941 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBRP36941 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBRP36941 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms