Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF4P34130 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF4P34130 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF4P34130 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF4P34130 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF4P34130 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF4P34130 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF4P34130 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF4P34130 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF4P34130 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF4P34130 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF4P34130 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF4P34130 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF4P34130 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF4P34130 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF4P34130 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF4P34130 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF4P34130 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF4P34130 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTF4P34130 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTF4P34130 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF4P34130 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms