Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H1P32780 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H1P32780 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H1P32780 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H1P32780 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2H1P32780 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2H1P32780 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2H1P32780 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2H1P32780 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2H1P32780 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2H1P32780 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2H1P32780 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2H1P32780 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H1P32780 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms