Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3AP31941 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms