Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms