Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD38P28907 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD38P28907 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD38P28907 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD38P28907 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD38P28907 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD38P28907 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD38P28907 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CD38P28907 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD38P28907 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD38P28907 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD38P28907 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD38P28907 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD38P28907 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD38P28907 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD38P28907 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD38P28907 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CD38P28907 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD38P28907 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms